Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2f8Q58FA4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
E2f8Q58FA4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2f8Q58FA4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms