Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf354cQ571J5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf354cQ571J5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms