Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prune2Q52KR3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prune2Q52KR3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prune2Q52KR3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.9 ms