Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Phactr4Q501J7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phactr4Q501J7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phactr4Q501J7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms