Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6040Q4QY32 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm6040Q4QY32 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm6040Q4QY32 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm6040Q4QY32 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6040Q4QY32 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms