Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trp53i11Q4QQM4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53i11Q4QQM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53i11Q4QQM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53i11Q4QQM4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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