Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Q2Q4KN81 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q2Q4KN81 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q2Q4KN81 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms