Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt35Q497I4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt35Q497I4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt35Q497I4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms