Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx25Q3ZT31 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx25Q3ZT31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms