Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc185Q3V118 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms