Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr7Q3V0I2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr7Q3V0I2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr7Q3V0I2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr7Q3V0I2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prr7Q3V0I2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prr7Q3V0I2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr7Q3V0I2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr7Q3V0I2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr7Q3V0I2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms