Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930596D02RikQ3V0H9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930596D02RikQ3V0H9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930596D02RikQ3V0H9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms