Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Garnl3Q3V0G7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms