Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim80Q3V061 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim80Q3V061 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim80Q3V061 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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