Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm12888Q3UW77 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm12888Q3UW77 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12888Q3UW77 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm12888Q3UW77 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm12888Q3UW77 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm12888Q3UW77 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm12888Q3UW77 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm12888Q3UW77 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm12888Q3UW77 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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