Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScimpQ3UU41 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScimpQ3UU41 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309.1 ms