Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
B230104I21RikQ3USW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B230104I21RikQ3USW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B230104I21RikQ3USW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B230104I21RikQ3USW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms