Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fchsd2Q3USJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fchsd2Q3USJ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fchsd2Q3USJ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fchsd2Q3USJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms