Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mindy4Q3UQI9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mindy4Q3UQI9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mindy4Q3UQI9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms