Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hdgfl2Q3UMU9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl2Q3UMU9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms