Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog7Q3UM29 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog7Q3UM29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cog7Q3UM29 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms