Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Uspl1Q3ULM6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uspl1Q3ULM6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Uspl1Q3ULM6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms