Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sf3b2Q3UJB0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sf3b2Q3UJB0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sf3b2Q3UJB0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sf3b2Q3UJB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms