Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm648Q3UJ22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm648Q3UJ22 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm648Q3UJ22 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms