Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf10Q3UIW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf10Q3UIW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf10Q3UIW5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms