Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LchnQ3UHG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LchnQ3UHG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LchnQ3UHG7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms