Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek10Q3UGM2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nek10Q3UGM2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms