Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Puf60Q3UEB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Puf60Q3UEB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Puf60Q3UEB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Puf60Q3UEB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms