Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms