Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf180Q3U827 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf180Q3U827 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf180Q3U827 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf180Q3U827 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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