Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U595 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U595 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q3U595 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U595 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U595 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U595 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U595 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q3U595 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U595 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U595 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U595 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U595 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U595 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q3U595 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q3U595 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q3U595 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U595 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U595 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U595 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U595 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U595 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q3U595 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U595 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U595 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U595 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q3U595 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q3U595 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q3U595 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q3U595 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U595 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U595 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U595 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U595 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q3U595 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U595 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U595 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U595 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U595 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q3U595 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q3U595 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q3U595 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms