Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem35bQ3U0Y2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms