Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tbc1d2bQ3U0J8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms