Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hace1Q3U0D9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hace1Q3U0D9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms