Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trmt1Q3TX08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt1Q3TX08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt1Q3TX08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt1Q3TX08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms