Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbxip1Q3TVI8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbxip1Q3TVI8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms