Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdnep1Q3TP92 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms