Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc127Q3TC33 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc127Q3TC33 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms