Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd8Q3TA59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Jmjd8Q3TA59 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Jmjd8Q3TA59 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms