Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prr27Q3SYJ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prr27Q3SYJ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prr27Q3SYJ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms