Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hddc2Q3SXD3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hddc2Q3SXD3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hddc2Q3SXD3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms