Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcerg1lQ3B807 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcerg1lQ3B807 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcerg1lQ3B807 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms