Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtl9Q32KG4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtl9Q32KG4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtl9Q32KG4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms