Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp8Q2V6D6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp8Q2V6D6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms