Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox4dQ2MDG0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rhox4dQ2MDG0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhox4dQ2MDG0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms