Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ptchd1Q14B62 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ptchd1Q14B62 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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ptchd1Q14B62 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ptchd1Q14B62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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