Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkpd1Q0VF94 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkpd1Q0VF94 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkpd1Q0VF94 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms