Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col19a1Q0VF58 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col19a1Q0VF58 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms