Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd12Q0VE29 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Samd12Q0VE29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samd12Q0VE29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms