Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap5bQ0V8T8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5bQ0V8T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap5bQ0V8T8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms